En los Hosting cPanel StartUp, puedes gestionar la versión de PHP por carpeta.

cPanel > Sección: 1H Software >> Administrador de versión de PHP 

Hosting cPanel version PHP

Ahora pulsa la carpeta en dónde quieres cambiar la versión de PHP.
Puede ser el directorio principal o cualquier otro.

Hosting cPanel version PHP carpeta

Ahora ya puedes selecciona la versión de PHP y pulsa “Salvar”.

Hosting cPanel seleccionar version PHP

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Versión cPanel 66.0 (build 24)